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现代医学认为，人体生命活动规律及其现象的广义之神和人心理活动的狭义之神，都属于（中枢神经）大脑的功能，历代医家亦有认同者。然“具有浓郁的中华民族传统文化气息的、具有丰富医学内涵的、具有强烈自然科学色彩的‘神论’学术内容”，在中国已经根深蒂固，无可扭转与改变。有学者认为：如果将“心藏神”、“心主神明”、“心者，五脏六腑之大主也”等的功能强行移回到大脑中去，一者则会使中医构建的传统的庞大理论体系受到冲击，使为医者（中医）无可适从；二者中国传统文化领域内的“心”的概念也会受到影响，如“心想事成”、“心理危机”、“心情郁闷、舒畅”、“心急吃不了热豆腐”、“心里乐开了花”等；三者有时在感情上一时接受不了这个事实，如“心火上炎→脑火上炎”、“心想事成→脑想事成”、“心理危机→脑理危机”、“心情郁闷、舒畅→脑清郁闷、舒畅”、“心急吃不了热豆腐→脑急吃不了热豆腐”、“心里乐开了花→脑里乐开了花”等。对于此，浙江中医学院赵辉贤教授深有感触的说道：“笔者不禁感概万千，也掺杂着诸多的无奈！《内经》之所以说是‘心主神明’，也许还有一个原因，即诸子百家无一不是以心为五脏之主……总之，‘心主神明’之说已沿袭二千余年，要改称‘脑主神明’，可谓积重难返。改变观念尚易，如今天语言里‘用脑想想’、‘多动动脑筋’、‘笨得像猪脑子’、‘脑髓搭牢’（杭州方言，意为脑不开窍）等用语已相当普遍，若要改造文字，就是异想天开了。况且文字仅仅是记录语言的一种符号，随它去也罢。然而医学就不同了，它性命攸关，岂可等闲视之？故笔者吁请中医学术界，现在已是吹响向中医脑科学进军号角的时候了！”（《周易与中医学》）
所以现当代一些贤达之士则明确指出：“由于时代的局限，《内经》不知道大脑才是主导全身生理机能和产生精神活动的实质性组织，而把思维情志功能分属于五脏，这与实际不符。”（雷顺群主编《内经多学科研究》）而施杞、周康主编《临床中医脑病学》则说道：“脑在人体占重要位置，主宰高级神经活动，诸如感觉、知觉、运动、情感、思维、意识、判断等，无不属于脑的功能。追溯既往，中医曾以‘心主神明’理论来概括人的精神活动，而现代医学亦沿用‘心’来代替脑的生理功能，如‘心理卫生’‘心理咨询’等，无形中使‘心’与‘脑’成为一种习用的同义词。李时珍提出‘脑为元神之府’，因而使众多学者能接受心脑共主神明的理论，但在实际应用中，仍大多认为脑主神明占主导地位。基于上述的情况，不难获知脑所发生的各种器质性与功能性疾病，均应归属于脑病之中。临床所见之神经系统疾病、精神科疾病以及心身疾患，莫不属于脑病范围，特别提出的是现代医学将脑与脊髓分列，而中医则历来强调‘脑为髓海’、‘诸髓者皆属于脑’，故脊髓疾病亦隶属于脑病范畴”所言甚是。
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